一审法院认为，各方当事人的争议焦点主要包括：

1. 关于方正证券公司涉案信息披露违法行为是否构成证券市场虚假陈述的问题。
2. 关于本案证券虚假陈述的实施日、揭露日、基准日如何确定以及基准价的计算方法问题。
3. 关于方正证券涉案信息披露违法行为与投资者主张的投资损失之间是否存在因果关系的问题。
4. 个人投资者的经济损失应如何认定以及方正证券公司应如何承担责任。

    关于焦点一。《虚假陈述若干规定》第17条规定：“证券市场虚假陈述，是指信息披露义务人违反证券法律规定，在证券发行或者交易过程中，对重大事件作出违背事实真相的虚假记载、误导性陈述，或者在披露信息时发生重大遗漏、不正当披露信息的行为。”而如何定义重大事件、重大遗漏，一审法院援引了《证券法》相关法条，认定方正集团公司与案外人利德科技公司、西藏昭融公司、西藏容大公司刻意隐瞒关联关系和签署涉案补充协议的相关情况，未依法告知方正证券，致使其IPO相关公告及上市后各期定期报告中，未依法披露上述公司的关联关系和涉案补充协议。

    关于焦点二，几个关键时间点的确定。证监会认定方正集团、方正证券在2011年8月9日首次公开发行股票时未披露涉案信息，该日是最早作出虚假陈述之日，故应确认为虚假陈述实施日。  关于虚假陈述揭露日，双方当事人对于2015年7月15日为本案虚假陈述揭露日均无异议。关于虚假陈述基准日和基准价的计算方法确定，根据《虚假陈述若干规定》第33条及第32条进行确认。

    关于焦点三的因果关系，《虚假陈述若干规定》第18条规定：“投资人具有以下情形的，人民法院应当认定虚假陈述与损害结果之间存在因果关系：（1）投资人所投资的是与虚假陈述直接关联的证券；（2）投资人在虚假陈述实施日及以后，至揭露日或者更正日之前买入该证券；（3）投资人在虚假陈述揭露日或者更正日及以后，因卖出该证券发生亏损，或者因持续持有该证券而产生亏损。”

    从以上规定来看，证券虚假陈述民事赔偿纠纷适用因果关系推定原则，投资者只须承担基本的举证责任，证明其在上述规定的时间范围内买入和卖出涉案股票存在损失，即应认定其损失与虚假陈述行为具有因果关系。投资者只需要证明其在相关时点进行方正证券股票交易并产生损失，即已完成其举证责任，证明了其主张的投资损失之间存在因果关系。

    关于焦点四经济损失的认定，需要考虑投资人的实际损失、以及证券市场系统风险、方正证券发布受到证监会调查的公告导致股价下跌导致的损失。